Histamine is een belangrijke signaalstof die op diverse plaatsen in het lichaam verschillende functies heeft. Het helpt bij het reguleren van de aanmaak van voldoende maagzuur in het maagdarmkanaal, fungeert als neurotransmitter in het centrale zenuwstelsel en heeft een functie in het afweersysteem. Helaas kan door allerlei oorzaken het histaminegehalte in de darmen hoger worden dan wenselijk is. Mogelijke klachten die daardoor kunnen optreden zijn diarree, hoofdpijn, loopneus, huidproblemen (rode vlekken, jeuk), ademhalingsproblemen, emotionele en/of gedragsstoringen, hartritmestoornissen, lage bloeddruk en slaapproblemen. Een histamine intolerantie kan de oorzaak zijn van vele chronische klachten. Als dit over het hoofd gezien wordt, kunnen therapieën niet of niet voldoende werken. Een onderzoek naar histamine uit de ontlasting is daarom bij alle chronische aandoeningen zeer nuttig. Een verhoogde waarde duidt dan op een histamine-intolerantie.